Na základě rektorského pověření dosud fakultu vede profesor Bohumil Vybíral. První děkan bude volen 19. ledna 2011 fakultním akademickým senátem, který se v tajné volbě usnáší o osobě, jíž navrhuje rektoru univerzity ke jmenování do děkanské funkce. Volební komise ve stanovené lhůtě zaregistrovala dva uchazeče o zvolení. Jsou jimi RNDr. PaedDr. Pavel Trojovský, Ph.D., a prof. Ing. Bohumil Vybíral, CSc.
Doktor Trojovský působí jako vedoucí Katedry matematiky PřF UHK a odborně se zabývá teorií čísel. Svůj volební program shrnuje v následujícím vyjádření: „Naše fakulta má v současné době poměrně málo vlastních studentů, tedy chceme akreditovat nové, pro studenty přitažlivé, bakalářské a navazující magisterské studijní obory a získat akreditaci alespoň jednoho doktorského studia. Nelze ovšem uvažovat jen o kvantitě studentů, ale především o jejich kvalitě. Musíme vytvořit aktivizující systém, a to nejen finanční, který bude motivovat studenty k lepším studijním výsledkům, publikačním výstupům a větší celospolečenské aktivitě. Každý akademický pracovník se musí svým úsilím, ať ve vědě nebo vzdělávání, zapříčinit o to, aby se naše mladá fakulta v dohledné době stala rovnocenným partnerem ostatních přírodovědeckých fakult v České republice. Cestu k realizaci tohoto cíle spatřuji v hlubší kooperaci s univerzitami a firmami působícími v našem nejbližším okolí. Tato spolupráce je však podmíněna moderními výzkumnými laboratořemi, a tedy obecně prostorovými možnostmi fakulty vůbec, proto je jedním z klíčových problémů realizace připravovaných plánů nové fakultní budovy."
Profesor Vybíral je pracovníkem Katedry fyziky PřF UHK, v dřívějších letech byl po několik funkčních období prorektorem univerzity, odborně se zabývá elektrodynamikou, molekulárními vlastnostmi vody a vzděláváním talentů na fyziku. Své představy o směřování fakulty charakterizuje těmito slovy: „Mým úkolem bude dokončení procesu akreditací vzdělávacích programů pro učitelství přírodovědných oborů, zlepšení ekonomiky vzdělávacího procesu u málopočetných studijních skupin a dokončení insignií fakulty. Jako zásadní vnímám potřebu vytvoření systému k získávání kvalitních uchazečů. Studenty chci také výrazněji motivovat k zapojení do studentské vědecké činnosti a k řešení vědeckovýzkumných projektů pracovišť. V souvislosti se současnými finančními restrikcemi ve veřejném školství se bude na PřF soustavně a přitom citlivě provádět nezbytná personální optimalizace spojená s odpovídajícím odměňováním pracovníků při důsledném uplatňování principu zásluhovosti. Úkolem pro nové vedení bude také vytvoření podmínek ke zvýšení úspěšnosti při získávání grantů v rámci grantové a technologické agentury. Jedním z prostředků podpory publikační činnosti bude založení dvou vědeckých časopisů, z nichž jeden bude mezinárodní.“
Volba kandidáta na funkci děkana se uskuteční 19. ledna 2011 v 15 hod. v učebně C 6 v budově „C“ UHK (nám. Svobody 301, Hradec Králové).